保护区系“三江并流”世界自然遗产片区之一，植被自然垂直分带十分明显，自然景观完整，有纬度最南最低的第四纪冰川，年融水达664万立方米，山上有众多的苔藓湿地。区内哈 巴雪山与玉龙雪山隔江相望共同构成举世闻名的虎跳峡，峡长20余公里，江水落差213米，分为上虎跳、中虎跳和下虎跳三段，共有险滩18处，江面最窄处仅20余米。

由于复杂的地貌和气候，使哈巴雪山成为了重要的物种基因库。这里蕴藏着丰富多样的珍稀动植物资源，茫茫林海中有云杉、冷杉、铁杉、红豆杉等上百钟乔木；有虫草、贝母、天麻、雪莲等名贵中药材；有杜鹃、报春、龙胆、百合等各种高山名贵花卉；有松茸、羊肚菌、猴头菌等136种野生食用菌。原始森林里还栖息着小熊猫、毛冠鹿、林麝、岩羊、藏马鸡、红腹角稚等珍禽异兽。

哈巴雪山自然保护区从所处的纬度上看属中亚热带范围，但由于海拔高低差异的地形特点，受金沙江峡谷和青藏高原气候上下交错的影响形成了独特的高山垂直气候。独特的地形地貌和气候同时又孕育出了垂直带谱明显的生态特征。这里是杜鹃、报春、龙胆、绿绒蒿等高山名花的分布中心和分化中心，众多的高山花卉不胜枚举。早在二十世纪初，英国、美国、奥地利等国家的学者曾纷纷到此采集植物标本、作考察，他们带去的大量杜鹃花种已成为欧美各国花园里的美丽 风景，因而，哈巴雪山地区被誉为“世界花园之母”！

杜鹃花是哈巴雪山自然保护区最引人入胜的风景，全世界约有杜鹃属850种，中国约有560种，云南约有250余种，横断山一带的杜鹃花品种竟占到全国总数的41%，而在哈巴雪山地区则可看

到分布在横断山一带杜鹃花种类的大部分品种。这不能不说是一个叹为观止的自然奇观。据调查在哈巴雪山保护区内常见的杜鹃花有：黄杯杜鹃、棕背杜鹃、亮叶杜鹃、大白花杜鹃、紫玉盘杜鹃、宽钟杜鹃、褐黄杜鹃、凝毛杜鹃、川滇杜鹃、腺房杜鹃、白雪杜鹃、环绕杜鹃、楔叶杜鹃、岩生杜鹃、紫蓝杜鹃、草原杜鹃、平卧杜鹃、毛喉杜鹃、樱草杜鹃等。

在海拔4000米以上地带除杜鹃外其他乔木已很难生长，这里就成了杜鹃的世界，花开时节成为杜鹃花的“海洋”，用花海来形容一点儿也不会觉得夸张。沉浸在杜鹃花的海洋里，你才会觉得哈巴雪山地区被誉为“世界花园之母”真是名副其实。

保护区内同时还分布着众多的高山冰蚀湖，大部分海拔都在3500米以上。其中以黑海、弯海、圆海、双海、黄海风光尤为秀美。

黑海：因水色如墨而得名，湖水幽深神秘，四时景色各不相同。最为奇特的是，人们只要站在湖边长啸数声，顿时便会细雨纷纷，有时甚至会暴雨倾盆而下，将人淋的如落汤鸡。这种呼风唤雨的奇特景观，为黑海增添了几多神秘。

黑海中还栖息着数量较多的高山溪鲵，俗称“雪鱼”或“娃娃鱼”，在气温合适的时候，“雪鱼”们会在湖底汇成环状，黑压压环绕在湖中，十分奇特。

圆海：位于黑海东北侧，海拔4150米。湖小而浅。最深处1。5米，比黑海低50米，但地处山坳，气温较暖和，积雪不厚，杜绝花盛开时节，湖花相映，分外妖娆。

双海：位于黑海西南侧，海拔4260米，由两个小湖组成，故名。湖水清澈幽深，周围地势平坦，杜鹃花点缀在湖畔，花色如玉。双海正南面，一雪峰兀然孤立，一缕白云常年相绕其上，缠绵依偎，形成奇景。

黄海：位于黑海西北侧，海拔4300米，水质清冽，最深处约2米。湖底全为黄色砂石，映于水中，水色金黄，湖四周照样分布着成片的杜鹃，花色多为紫色和红色。离湖不远的山坡上，有大片的黄杯杜鹃林。

除了雪山、杜鹃、湖泊、森林外，这里还分布着许多悬泉飞瀑。或如丝如帘、丝丝缕缕，或气势汹涌、声喧如雷。